Thời gian qua, các bệnh viện công lập khi chuyển đổi sang cơ chế tự chủ gặp nhiều khó khăn, thách thức. Tự chủ, đồng nghĩa bệnh viện không thể trông chờ vào nguồn vốn nhà nước mà phải tự thu, tự chi tương đương như một doanh nghiệp. Cố gắng xoay xở để gồng gánh cân đối thu – chi đang là thực trạng tại các bệnh viện thực hiện tự chủ hiện nay.